按《外國企業常駐代表機構納稅事項通知書》的規定，每季度終了后15日內履行網上納稅手續，并將網上申報的季度所得稅申報表一份，已完稅的稅收繳款書第六聯原件，在規定的時限內郵寄或送到納稅申報窗口，逾期將按《征管法》規定予以處罰。
代表機構在年度終了后四個月內應在網上履行年度所得稅申報手續，并將網上申報的年度申報表及年度所得稅匯算清繳的相關資料報送稅務機關，逾期將按《征管法》規定予以處罰。
按經費支出換算收入計算所得稅的方法：
代表處本期經費支出額÷（1－核定利潤率10％－營業稅稅率5％）＝收入額
收入額×核定利潤率10％＝應納稅所得額
應納營業稅額=收入額×適用稅率5％
應納所得稅額＝應納稅所得額×適用稅率25％
代表處納稅總額=應納營業稅額+應納所得稅額
對于人數較少的代表處，可以將納稅申報委托給專業的代理記賬公司。